Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPKQ9BS16 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPKQ9BS16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms