Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP3Q9BQQ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP3Q9BQQ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms