Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP9Q99956 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP9Q99956 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUSP9Q99956 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms