Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MMP19Q99542 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMP19Q99542 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP19Q99542 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms