Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORT1Q99523 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SORT1Q99523 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORT1Q99523 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms