Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAP1L3Q99457 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAP1L3Q99457 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms