Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHOX2BQ99453 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHOX2BQ99453 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHOX2BQ99453 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms