Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YME1L1Q96TA2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YME1L1Q96TA2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms