Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SIN3AQ96ST3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SIN3AQ96ST3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIN3AQ96ST3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms