Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPXM1Q96SM3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPXM1Q96SM3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPXM1Q96SM3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms