Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
IFT140Q96RY7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC39.34■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
IFT140Q96RY7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
IFT140Q96RY7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
IFT140Q96RY7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
IFT140Q96RY7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms