Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG1Q96Q15 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG1Q96Q15 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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