Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD4LQ96PU5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4LQ96PU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEDD4LQ96PU5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms