Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP4Q96PP9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP4Q96PP9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GBP4Q96PP9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms