Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSSK3Q96PN8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms