Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD27Q96NW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ANKRD27Q96NW4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD27Q96NW4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms