Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FRMD6Q96NE9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FRMD6Q96NE9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms