Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ROBO3Q96MS0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ROBO3Q96MS0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms