Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C12orf66Q96MD2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms