Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL15Q96M94 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms