Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM46AQ96IP4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM46AQ96IP4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms