Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD3Q96ES6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD3Q96ES6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms