Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms