Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms