Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAF2Q96CS3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms