Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP4CQ96CF2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHMP4CQ96CF2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP4CQ96CF2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms