Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF1Q96CC6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF1Q96CC6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDF1Q96CC6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms