Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ULK4Q96C45 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms