Protein–RNA interactions for Protein: Q96B02

UBE2W, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2WQ96B02 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2WQ96B02 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2WQ96B02 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms