Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM143Q96AN5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM143Q96AN5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM143Q96AN5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms