Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP3Q969Y2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP3Q969Y2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTPBP3Q969Y2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTPBP3Q969Y2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTPBP3Q969Y2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTPBP3Q969Y2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTPBP3Q969Y2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTPBP3Q969Y2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTPBP3Q969Y2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTPBP3Q969Y2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms