Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NXPE3Q969Y0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXPE3Q969Y0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms