Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP4Q969X6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms