Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms