Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOP1MTQ969P6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOP1MTQ969P6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms