Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SMARCE1Q969G3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCE1Q969G3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCE1Q969G3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.9 ms