Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C6Q969F1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C6Q969F1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C6Q969F1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms