Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP4Q969E2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP4Q969E2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.1 ms