Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRF1Q92994 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BRF1Q92994 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms