Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC4Q92889 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC4Q92889 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms