Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX19Q92543 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX19Q92543 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms