Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMPDL3BQ92485 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPDL3BQ92485 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms