Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN9Q8WX39 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN9Q8WX39 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN9Q8WX39 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms