Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP27Q8WVK2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP27Q8WVK2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP27Q8WVK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms