Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE1Q8WV22 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NSMCE1Q8WV22 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE1Q8WV22 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms