Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC12Q8WUD4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms