Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GIPC3Q8TF64 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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