Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA2Q8TDQ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms