Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTRT1Q8TDG2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT1Q8TDG2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms