Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRSK1Q8TDC3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRSK1Q8TDC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRSK1Q8TDC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms